La OEI tiene en su mandato la misión de actuar en el campo de la ciencia. Es imprescindible que los países iberoamericanos asuman la decisión estratégica de fortalecer su capacidad científica, tecnología, de investigación e innovación. La visión de la OEI es hacerlo de manera conectada con sus otros dos mandatos, educación y cultura, con una perspectiva de interacción con la sociedad y el entorno, así como en el marco de la Agenda Internacional 2030 de los Objetivos de Desarrollo Sostenible.
El Observatorio Iberoamericano de la Ciencia, la Tecnología y la Sociedad (OCTS) fue creado en 2008 con la misión de desarrollar un programa de estudios estratégicos en Ciencia, Tecnología y Sociedad que indague en las fronteras de la ciencia y de las demandas sociales de los pueblos de Iberoamérica.
La búsqueda, el procesamiento y la diseminación de la información constituyen el principal foco de atención para el OCTS. Con este fin, su tarea más importante es obtener evidencias acerca de las capacidades, los desafíos y las oportunidades de los países de Iberoamérica en materia de ciencia y tecnología, así como de sus aptitudes para la práctica de la investigación científica, el desarrollo tecnológico y la innovación. También la cultura científica forma parte del núcleo central de sus preocupaciones, en la medida que la participación ciudadana es condición necesaria para la democratización de la toma de decisiones en estos temas de naturaleza estratégica.